Основой фамилии Меньшенина послужило мирское имя Меньшеня. Фамилия Меньшенина образована от мирского имени Меньшеня. Обычно родители называли так самого младшего ребенка в семье. Согласно другой гипотезе, фамилия Меньшенина восходит к прозвищу Меньшеня, которое могли дать и взрослому человеку маленького роста. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Меньшеня, со временем получил фамилию Меньшенина.