Основой фамилии Меньшенин послужило мирское имя Меньшеня. Целью этой древнейшей традиции была защита от «нечисти» и «злых духов», которые не должны знать истинное имя человека. Фамилия Меньшенин образована от мирского имени Меньшеня. Обычно родители называли так самого младшего ребенка в семье. Согласно другой гипотезе, фамилия Меньшенин восходит к прозвищу Меньшеня, которое могли дать и взрослому человеку маленького роста. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Меньшой, со временем получил фамилию Меньшенин.