Фамилия Меснеков — редкая и морфологически неочевидная. На первый взгляд она кажется образованной по стандартной патронимической модели «основа + -ов», но сама основа ставит в тупик: что такое «Меснек»?

Скорее всего, перед нами фамилия, в основе которой лежит прозвище или вариант личного имени, подвергшийся искажению при записи. Самая правдоподобная версия — связь с тюркским корнем «месне» (масна, мисна). В ряде тюркских языков это слово имеет значение «вторая половина», «пара» или «подобный». В персидском «маснави» — это поэма в рифмованных двустишиях. Однако в контексте прозвища логичнее предположить, что Меснеком могли назвать человека, который был чьей-то точной копией, двойником, или же родившегося вторым в семье (второго сына, как Парфёнов от Парфёна).

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — это сращение предлога и топонима: «месне» могло быть диалектным названием болота, топи (от финно-угорского корня). Тогда Меснеков — это «живущий у болота». Но эта гипотеза слаба, так как суффикс -ек нехарактерен для таких образований, и фамилия скорее звучала бы как Месняков.

Суффикс -ов указывает на русское происхождение фамилии, но сама основа — явно иноязычная. Такие фамилии нередко встречались в среде служилых людей, казачества или крестьян южных и восточных губерний, где активно шло смешение славянского и тюркского населения. Встречаемость фамилии крайне низкая, в основном на юге России и в Казахстане, что косвенно подтверждает тюркскую версию происхождения прозвища. Носитель фамилии мог быть потомком человека, которого в округе знали под прозвищем Меснек, а при переписи или верстании на службу фамилию записали на русский лад.