Фамилия Месщеряков — яркий пример того, как одна опечатка или диалектное произношение могут породить новую фамилию. В подавляющем большинстве случаев это искажённый вариант фамилии Мещеряков. Основа здесь — этноним «мещеряк», так в прошлом называли жителей исторической области Мещера (земли на стыке современных Рязанской, Владимирской и Московской областей). Мещеряками именовали как финно-угорское племя мещера, так и русских переселенцев, освоивших эти края. Таким образом, предок носителя фамилии был выходцем из Мещеры, и его прозвали «мещеряк» или «мещеряка».

Суффикс -ов в окончании указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ или названий: «чей?» — сын Мещеряка. Написание через «с» (Месщеряков) — результат ассимиляции звуков в речи: сочетание «щ» после «с» упрощает произношение, и буква «щ» на письме заменяет «щ». В старых документах, особенно до реформы орфографии, такие варианты встречались часто, так как запись велась на слух. Встречается и написание Мещеряков — оно считается нормативным, но вариант с «с» не ошибка, а исторически сложившаяся форма.

Редко, но возможно и происхождение от слова «мес» (от тюркского «мес» — «медь» или «медный»), но это маловероятно: суффикс -ер- и окончание -як нехарактерны для тюркских заимствований в русском языке. Скорее всего, это народная этимология. Географически фамилия Месщеряков (и её варианты) чаще всего встречается в центральных и южных регионах России, где были сильны миграционные потоки из Мещеры.

Сословной привязки у фамилии нет: мещеряками могли быть и крестьяне, и служилые люди, и купцы. Фамилия не указывает на дворянство или духовенство, а лишь на место происхождения. В современном русском языке оба написания — Мещеряков и Месщеряков — воспринимаются как равноправные, хотя в официальных документах чаще фиксируется первый вариант.