Фамилия Месяцына — женская форма фамилии Месяцын, и её разумнее всего разбирать через мужской вариант. Модель образования простая: основа «Месяц» плюс суффикс -ын. В русской ономастике суффикс -ын (как и -ин) указывает на принадлежность: Месяцын — «сын Месяца» или «человек из рода Месяца». В отличие от более распространённого -ов/-ев, -ын встречается реже и часто привязан к основам, оканчивающимся на -а/-я, но здесь мы видим исключение: основа на твёрдый согласный «ц», а суффикс всё равно -ын, а не -ов. Это может говорить о севернорусском или западнорусском происхождении фамилии — в этих регионах суффикс -ын/-ин был более живуч и вытеснял стандартный -ов.

Корень «месяц» мог означать несколько вещей. Первое и самое прямое — прозвище человека, родившегося в новолуние или полнолуние, либо того, кто работал по ночам, при луне. Второе — указание на внешность: круглолицего, «луноликого» человека в народе могли прозвать Месяцем. Третья версия связана с календарём: в старину «месяцем» называли не только небесное тело, но и период времени, и прозвище мог получить человек, родившийся в какой-то примечательный месяц (например, в месяц сенокоса или жатвы). Есть и более редкая гипотеза: в некоторых говорах «месяц» — это вид серпа или косы, так что прозвище могло закрепиться за крестьянином, который хорошо владел этим инструментом.

Сословный состав фамилии, скорее всего, крестьянский или мещанский. В дворянской среде фамилии на -ын/-ин от прозвищ встречаются, но реже, а «Месяцын» не фигурирует в родословных книгах. Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России — в переписях XVII–XVIII веков следы носителей можно найти в Вологодской, Костромской и Вятской землях. В современной России фамилия редкая, не входит в топ-5000 по частоте, что делает её ценной для локальной генеалогии.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Месяцев, Месяц, Месячих — показывает, что Месяцын стоит особняком из-за суффикса. Если Месяцев — это типичная «великорусская» форма отчества с -ев, то Месяцын сохранил архаичный вариант, который мог закрепиться в письменных документах раньше, чем фамилия унифицировалась. Поэтому для потомков Месяцыных это не просто фамилия, а маркер определённого региона и времени — возможно, их предки получили её ещё в допетровскую эпоху, когда суффиксы не были строго стандартизированы.