Фамилия Мэтто — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с исконно славянскими корнями. В русском языке нет слова «мэтто» или «метто» с устоявшимся бытовым значением, а суффикс -о в такой форме нетипичен для восточнославянских фамилий (кроме украинских на -о, но там основа обычно другая). Поэтому первая и самая вероятная версия — фамилия заимствованная, причём не из ближнего зарубежья.

Скорее всего, Мэтто — это итальянизированная или французизированная фамилия, попавшая в Россию через миграцию, браки или культурные связи. В итальянском языке слово matto означает «сумасшедший», «безумный» или «чудак» (от латинского mattus — «одурманенный»). Такое прозвище в Италии могли дать человеку с нестандартным поведением, шуту или просто вспыльчивому человеку. В русском написании через «э» (Мэтто, а не Метто) часто встречается именно в передаче итальянских фамилий (ср. Мэттью, Мэрилин — калька с английского, но для итальянского это тоже возможно). Фамилия могла закрепиться за потомками итальянских архитекторов, художников или ремесленников, работавших в России в XVIII–XIX веках.

Вторая, менее вероятная версия — финно-угорское происхождение. В карельском и финском языках есть слово metto, означающее «глухарка» или «тетёрка». Если предок носителя фамилии жил на северо-западе России (Карелия, Ленинградская область), прозвище Мэтто могло перейти в фамилию через местные говоры. Однако написание через твёрдое «э» здесь менее органично: в карельских фамилиях обычно пишут «Метто» или «Меттонен». Версия с итальянским корнем выглядит убедительнее из-за точного совпадения значения и графики.

Географически фамилия Мэтто в России встречается крайне редко, в основном в крупных городах (Москва, Санкт-Петербург) и среди потомков дворянских или купеческих родов, имевших западные связи. Сословно определить предков сложно: это могли быть и обрусевшие итальянцы, и выходцы из Прибалтики, принявшие православие. Единственное, что можно сказать с уверенностью: фамилия не крестьянская и не массовая — её носители, вероятно, были людьми с необычной биографией, связанной с Европой или творческими профессиями.