Фамилия Мейне — это редкий для России случай, когда фамилия пришла не из крестьянской среды, а, скорее всего, из прибалтийско-немецкого или еврейского ашкеназского круга. В русском языке она не подчиняется привычной словообразовательной модели с суффиксами -ов, -ин или -ский, поэтому её происхождение нужно искать не в славянских корнях, а в западноевропейских языках.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с немецкой фамилией Meine. В Германии она могла возникнуть как сокращённая форма от имени Мейнхард (Meinhard), где корень «mein» восходит к древневерхненемецкому «magin» — «сила, мощь». То есть в основе лежало прозвище или именование «сильный», «могучий». Второй вариант: Meine — это топонимическая фамилия, образованная от названия населённого пункта Майне (Meine) в Нижней Саксонии. Переселенец из этого места мог получить фамилию по месту выхода.

В Российской империи фамилия Мейне встречалась прежде всего среди остзейских немцев (жителей Прибалтики) и среди евреев, которые в XIX веке нередко получали фамилии немецкого звучания при переписях. В еврейском варианте фамилия могла быть записана как Мейне, Майне или Мейн — в зависимости от местной канцелярии. Никакого специфического «ремесленного» значения у неё нет, это чисто именная или географическая метка.

В отличие от многих русских фамилий, у Мейне нет суффикса, указывающего на принадлежность («чей?»). Это так называемая «чистая» основа, которая в русском языке не склонялась по падежам как типичная славянская фамилия, что и закрепило её в неизменной форме. Носители этой фамилии в России — потомки либо немецких колонистов, либо еврейских семей, ассимилировавшихся в городской среде. Встретить её можно в метрических книгах Петербурга, Москвы и городов Поволжья, где были немецкие общины.