Фамилия Мезер — редкий пример, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает все остальные версии. В русском языке нет корня «мез-», который мог бы дать прозвище или профессию, а суффикс -ер нетипичен для восточнославянских фамилий. Такое окончание характерно для немецких и еврейских фамилий, образованных от названий профессий или места жительства. Поэтому первое, что приходит в голову при анализе, — немецкое слово «Messer» (нож) или топоним Мезер (Möser) — название нескольких населённых пунктов в Германии. Однако в русской записи фамилия чаще всего фиксировалась без удвоения согласной и с одним «з», что может указывать на иной источник.

Более убедительная версия связывает Мезер с еврейскими корнями. В идише и немецких диалектах «Maser» (мазер) — это «токарь» или «резчик по дереву», а в некоторых говорах — «изготовитель деревянных мисок». Поскольку в Российской империи еврейские фамилии часто записывали на слух, вариант Мезер мог возникнуть как фонетическая передача этой профессии. Альтернативно, фамилия могла произойти от названия города Мезер (Meseer) в Чехии или местечка Мезерич (ныне Велике-Мезиржичи) — в этом случае она указывала бы на выходца из этих мест.

Словообразовательная модель проста: основа (профессия или топоним) плюс типичный немецкий суффикс -er, означающий «тот, кто делает» или «тот, кто оттуда». В русском языке фамилия не склонялась по падежам женского рода, а мужской вариант мог получать окончание -ов (Мезеров), но в исходной форме Мезер оставалась неизменной. Такой тип фамилий был распространён среди немецких колонистов Поволжья и Причерноморья, а также среди еврейского населения западных губерний.

География фамилии подтверждает эту двойственность. В дореволюционных метрических книгах Мезеры встречаются в Херсонской и Екатеринославской губерниях (немецкие колонии), а также в Витебской и Минской губерниях (еврейские местечки). В советское время фамилия рассеялась, но осталась малочисленной — носителей по всей России не более нескольких сотен.

Если ваш предок был Мезер, он с высокой вероятностью был либо ремесленником-резчиком, либо переселенцем из немецкой колонии, либо выходцем из местечка с похожим названием. Точнее определить помог бы анализ региональных записей: в немецких общинах фамилию часто писали как Messer, а в еврейских — как Mезер или Мазер.