Фамилия Межерецков — редкий случай, когда географический корень сохранился почти без искажений, но в неожиданном суффиксальном оформлении. В основе лежит название населённого пункта вроде Межерецк, Межеречье или Межерка. Такие топонимы, в свою очередь, образованы от словосочетания «меж рек» — то есть «между реками». Человек, живший на землях, зажатых двумя водными артериями, получал прозвище Межерец или Межерецкий, а его потомки записывались уже как Межерецковы.

Обратим внимание на суффикс. Фамилии на -ов/-ев чаще всего образуются от прозвищ или имён, оканчивающихся на согласный: Иванов, Петров. Но здесь основа — Межерецк, а не Межерец. Это указывает, что исходным было не личное прозвище, а название места, которое и дало фамилию по модели «выходец из Межерецка». Обычно такие фамилии закрепляются за переселенцами: когда человек покидал родную деревню и переезжал в другой уезд, его записывали как «Межерецков» — то есть «сын того, кто из Межерецка».

География фамилии сегодня размыта, но логично предположить её корни в регионах с густой речной сетью — в бассейне Днепра, Волги или Оки. Названия вроде Межеречье, Межерки, Межерецк встречаются в бывших Смоленской, Тверской, Псковской губерниях. В белорусском и украинском ономастиконе есть близкие фамилии — Межерецкий, Межерский, — что подтверждает западное происхождение модели.

Важно не путать Межерецкова с Межерицким или Межерским — это разные гнёзда, хотя корень один. Фамилия Межерецков могла возникнуть и как вариант написания от «Межерецкий» через народную этимологию: суффикс -ов воспринимался как более «русский» и привычный, чем -ий. В документах XVII–XVIII веков такие переделки были обычным делом: приказные писцы часто унифицировали окончания по образцу крестьянских фамилий.