Фамилия Межжерин — один из тех случаев, когда географический термин стал прозвищем, а затем закрепился как фамилия. Её основа — слово «меж» (между) и «жердь» или «жердина». В русских говорах «межжердье» или «межжердь» означало пространство между жердями, например, в изгороди или в строительной конструкции. Однако есть и более конкретное значение: в некоторых регионах так называли участок земли, расположенный между двумя реками, оврагами или лесами — своего рода «междуречье» в миниатюре. Человек, получивший прозвище Межжера, мог жить на таком участке или владеть им.

Суффикс -ин в фамилии Межжерин указывает на принадлежность: «чей?» — Межжерин, то есть сын или потомок Межжеры. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ или названий местности. Двойная «ж» в корне — результат ассимиляции: приставка «меж» и корень «жер» слились в произношении, и на письме это закрепилось. Встречаются варианты написания с одной «ж» (Межерин), но форма Межжерин более архаична и точнее отражает исходное звучание.

Версия о происхождении от слова «межа» (граница) менее вероятна. Хотя «межа» и «меж» — однокоренные, фамилия Межерин от «межи» существовала бы с другим суффиксом или окончанием. А вот связь с «жердью» поддерживается диалектными данными: в псковских и тверских говорах «межжердье» — это именно полоса земли между двумя рядами жердей, например, в огороде или на выгоне. Таким образом, предок Межжериных мог быть крестьянином, чей надел имел характерную узкую форму, или же плотником, работавшим с жердями.

Социально фамилия, скорее всего, крестьянская или однодворческая, распространённая в центральных и южных губерниях России. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении — возможно, из одного села или волости, где прозвище прижилось. В дореволюционных документах фамилия фиксируется в Тамбовской, Рязанской и Воронежской губерниях, что косвенно подтверждает связь с чернозёмной полосой, где межевание земли было особенно актуально.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Меженин, Межевой, Межерицкий — показывает, что Межжерин стоит особняком: у него нет суффикса -ск-, характерного для дворянских или польских фамилий, и нет окончания -ой, типичного для прилагательных. Это чисто русская, «бытовая» фамилия, образованная напрямую от прозвища без дополнительных формальных наслоений.