Фамилию Мезинцев можно разобрать на два элемента: корень «мезин-» и патронимический суффикс «-цев». Суффикс «-цев» — редкая разновидность «-ов», характерная для фамилий, образованных от прозвищ или названий, оканчивающихся на «-ец». В данном случае основа — «мезинец». Кто такой мезинец? Скорее всего, человек по прозвищу Мезинец. Слово «мезинец» в старых русских говорах означало мизинец, самый маленький палец руки или ноги. Прозвище Мезинец могли дать низкорослому, щуплому человеку либо младшему сыну в семье — по той же логике, по которой младшего ребёнка называли Меньшиком или Малютой. В некоторых диалектах «мезинец» обозначало и вообще нечто малое, незначительное, так что прозвище могло закрепиться за человеком невысокого роста или невидного положения.

Встречается и другая версия: связь с географическим названием. В России есть несколько топонимов с корнем «Мезин» — например, деревня Мезино в бывшей Владимирской губернии или село Мезинец в Орловской области. Житель такого места мог получить прозвище Мезинец, а его потомки — фамилию Мезинцевы. Однако первая версия, от прозвища по физической особенности, выглядит более распространённой и логичной: фамилий, образованных от названий пальцев (Большаков, Указов, Безымяннов), в русском ономастиконе немало, и Мезинцев вписывается в этот ряд.

Суффикс «-цев» указывает на то, что фамилия сложилась в среде служилых или крестьянских слоёв, где патронимическая модель на «-ов/-ев» была основной, а «-цев» — её локальным вариантом. В документах XVII–XVIII веков встречаются записи крестьян и посадских людей с такой фамилией, преимущественно в центральных и южных уездах России. Сословная принадлежность предков Мезинцевых, скорее всего, была крестьянской или мещанской — дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не зафиксировано.

Ударение в фамилии традиционно падает на первый слог: Ме́зинцев, хотя в разговорной речи иногда смещается на второй. Это не ошибка, а следствие диалектной вариативности. В целом фамилия редкая, но не исчезающая: по данным современных телефонных справочников, её носители живут в Центральной России, Поволжье и на Урале.