Фамилия Мидушкин — одна из тех, что не лежат на поверхности. Её основа неочевидна, а суффикс заставляет задуматься. Формально это типичная русская фамилия с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Мидушкин, то есть сын или потомок человека по прозвищу или имени Мидушка. Но что стоит за этим прозвищем?

Самый вероятный корень — диалектное слово «мидус» или «мидуха», которое в некоторых северных и сибирских говорах означало медлительного, вялого или задумчивого человека. Такие прозвища давали не в обиду, а как меткую бытовую характеристику. Подобные фамилии на -ушкин (ср. Милушкин, Микушкин) часто образовывались от уменьшительных форм крестильных имён. Имя Мидушка могло быть производным от Дмитрия (через народные формы Митя, Мидя, Мидуха) или от Емельяна (Емидушка). В этом случае фамилия — отчество второго порядка: внук Мидушки, сын человека, которого в быту звали уменьшительно Мидушка.

География фамилии подсказывает, что её носители исторически концентрировались в центральных и поволжских губерниях, особенно в бывшей Тверской и Нижегородской. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, прозвище закрепилось в одном-двух сёлах, а потом разошлось с переселенцами.

Есть и более редкая версия — связь с финно-угорскими языками, где «миду» или «миту» означало мёд или сладость. В этом случае Мидушка могло быть прозвищем пасечника или торговца мёдом. Однако для центральной России такое заимствование маловероятно: фамилия слишком русская по суффиксу и звучанию, чтобы быть напрямую заимствованной из соседних языков. Основная версия — прозвище по характеру или производное от канонического имени — остаётся самой правдоподобной.