Фамилия Мигалкович отвечает на вопрос «чей ты будешь?»: суффикс -ович указывает на отчество, а значит, родоначальника звали Мигалко. Это типичная западнорусская и белорусская модель образования фамилий, где -ович/-евич добавляли к основе прозвища или имени, подчёркивая прямую связь с отцом. Буквально Мигалкович — «сын Мигалка».

В основе лежит прозвище Мигалко, которое В. И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» связывает с глаголом «мигать» — «хлопать веками, жмуриться и тотчас опять открывать глаза, моргать». Так могли прозвать человека с привычкой часто моргать. Но есть и второй смысловой оттенок: в псковских и тверских говорах бытовал глагол «мигалить» — «хлопать глазами, зевать». Тогда прозвище описывало не физическую особенность, а характер: рассеянного, невнимательного, вечно «зевающего по сторонам» человека. Обе версии правдоподобны, и вторая не менее убедительна, чем первая, поскольку опирается на реальный диалектный материал.

Исторические документы сохранили родственные прозвища и фамилии. С. Б. Веселовский в своих работах упоминает Мигача, крестьянина 1545 года из Новгорода, Кирилла Мигачева, холопа 1603 года, и Федота Михайловича Мигуна Годунова (1566 год). Эти примеры показывают, что корень «миг» активно использовался в прозвищах разных социальных слоёв — от крестьян до служилых людей. Позже прозвище Мигалко, которое изначально присоединяли к наследственному имени, полностью заменило его и в быту, и в официальных бумагах, закрепившись за потомками.

Среди носителей фамилии есть и известные люди, например словацкий поэт Йозер Мигалкович (род. 1935). Это напоминает, что фамилия бытует не только в восточнославянских землях, но и за их пределами, хотя её корни — в народной прозвищной традиции, где наблюдательность соседей превращалась в вечное семейное имя.