Фамилия Мигилатов — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять её смысл, нужно разобрать словообразовательную цепочку, и здесь есть две основные версии, одна из которых заметно убедительнее другой.

Наиболее вероятная основа — тюркское прозвище или имя Мигилат. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) есть корень «мигил» или «мыйыл», который может означать «тихий», «спокойный», «кроткий». Суффикс -ат в таких именах часто носил усилительный или ласкательный оттенок. Таким образом, Мигилат — это «очень спокойный», «тихоня», и такое прозвище давали человеку с мягким, неконфликтным нравом. Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Мигилат добавили патронимический суффикс -ов, и получилось «сын Мигилата» — Мигилатов.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с арабским именем Микаил (Михаил в исламской традиции). В некоторых тюркских диалектах имя могло трансформироваться в Мигил, а затем в Мигилат. Однако эта гипотеза слабее: фонетический переход «к» в «г» и появление суффикса -ат не имеют под собой убедительной региональной основы, чаще встречается прямое заимствование имени Микаил без таких изменений.

Географически фамилия Мигилатов тяготеет к регионам с сильным тюркским субстратом — Поволжье, Приуралье, юг Сибири. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении: вероятно, один род, основатель которого и получил прозвище Мигилат, дал начало всем носителям фамилии. Сословная принадлежность могла быть разной — от крестьян до служилых татар, но без конкретных архивных данных об этом судить сложно.

Уникальность этой фамилии в том, что она почти не имеет однокоренных «собратьев». В отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Смирнов, Мигилатов — штучный экземпляр, сохранивший в своей основе редкое прозвище, которое вряд ли встретишь в современных словарях имён.