Фамилия Михаенкова образована от мужского имени Михай — украинской народной формы крестильного имени Михаил. В переводе с древнееврейского оно означает «благонравный», хотя в библейской традиции имя архангела Михаила чаще толкуют как «кто как Бог». Начало фамилии положил человек по имени Михай, а его потомки со временем закрепили за собой прозвание Михаенко, которое затем обросло типичным для русских фамилий окончанием -а и стало Михаенковой.

Суффикс -енко в основе фамилии — верный маркер восточно-украинского происхождения. Такая модель отчеств была широко распространена на Левобережной Украине, в частности в Полтавской и Черниговской губерниях, откуда фамилии с этим суффиксом в XVIII–XIX веках расходились по всей Российской империи. Если коротко: Михаенкова — это потомок Михая, сын или дочь Михаенко, а сама фамилия отвечает на вопрос «чей?».

Интересно, что имя Михай не было официальным церковным вариантом — в метриках и документах человека могли записать как Михаила, а в быту звать Михаем. Поэтому фамилия Михаенков и её женская форма Михаенкова часто возникали в среде, где живая речь расходилась с канцелярской записью. Родственные фамилии того же гнезда — Михайленко, Михайлюк, Михайлов — показывают, как одно имя разошлось по разным словообразовательным моделям: от украинского уменьшительного до русского патронимического суффикса.

Сословной привязки у фамилии нет: её могли носить и казаки, и крестьяне, и мещане. Поскольку -енко — суффикс отчества, а не прозвища, фамилия не указывает на ремесло или характер предка, а лишь фиксирует его имя. Носительницы фамилии Михаенкова сегодня встречаются по всей России, но чаще всего — в регионах, куда шла миграция с Украины: на Кубани, в Поволжье и в Сибири.