Микун - это просторечная форма крестильного мужского имени Михаил, которое имеет еврейское происхождение и в переводе означает «подобный Богу». Святой Михаил -один из семи архангелов иудейской религии. Он считается покровителем солдат. Скорее всего, основатель рода Микуновых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Такое предположение объясняется тем, что фамилии, образованные от полной формы имени, имела в основном социальная верхушка, знать, или семьи, пользовавшиеся в данной местности большим авторитетом, представителей которых соседи уважительно звали полным именем, в отличие от других сословий, звавшихся, как правило, уменьшительными, производными, обиходными именами Существует и другая версия, согласно которой, фамилия Микунова образована от прозвища Микун, которое восходит к глаголу «микать» - «мямлить, говорить, читать вяло и невнятно». Следовательно, Микуном могли назвать косноязычного, нерешительного и медлительного человека. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Микун, со временем получил фамилию Микунова.