Фамилия Микутова — женская форма, а её мужской вариант — Микутов. В русских фамилиях суффикс -ов указывает на принадлежность: Микутов буквально значит «сын Микута» или «человек из рода Микута». В основе лежит прозвище или неканоническое имя Микут.

Что такое Микут? Это уменьшительная форма от крестильного имени Никита. В народной речи имя Никита дробилось на множество вариантов: Микита, Микей, Микула, Микулка. Форма Микут — одна из них, скорее всего, южнорусская или украинская. Такое стяжение (Никита → Микита → Микут) — нормальный процесс для живой речи, где имена «обкатывались» до коротких и удобных обиходных форм.

Есть и вторая версия, менее вероятная, но возможная. В некоторых говорах «микут» могли назвать человека с прищуром или того, кто щурится (от глагола «мигать», «мигнуть»). Однако большинство фамилий на -ут (как Микут, Данут, Ванут) восходят именно к сокращениям от крестильных имён, а не к прозвищам по внешности. Поэтому самая надёжная трактовка — «потомок Никиты».

Географически фамилия Микутовы встречается не часто, но заметна в Курской, Белгородской областях и на востоке Украины. Это зона, где говоры долго сохраняли аканье и мягкое произношение имён, что и дало форму Микита → Микут.

Если сравнивать с однокоренными: Микутов отличается от Микулина (от Микула — народная форма Николая) и от Микитова (где корень Микит). То есть Микутов — самостоятельная ветвь, а не описка или диалектный вариант другой фамилии. Носители фамилии, скорее всего, потомки крестьян или однодворцев из южных уездов России — сословия, которое часто фиксировало фамилии именно по обиходным формам имён, а не по полным церковным.