Фамилия Милимука — редкая и необычная для русского уха. Её происхождение почти наверняка связано не с русским, а с украинским или белорусским языковым фоном. Ключ к разгадке — в суффиксе «-ук». Этот суффикс в восточнославянских фамилиях (особенно на западе Украины и в Полесье) указывает на принадлежность: «чей-то сын» или «ученик кого-то». Соответственно, Милимука — это «сын Милимуки» или, что более вероятно, «человек, относящийся к Милимуке».

Сама основа «Милимук» — сложная и, скорее всего, составная. Первая часть «мили-» может восходить к украинскому «милий» (милый, любимый) или к имени Милий (от латинского «miles» — воин, солдатик). Вторая часть «-мука» — прямое указание на муку, страдание, мучение. В древнерусском и украинском языках «мука» означала именно пытку, страдание, а не только продукт помола. Таким образом, прозвище Милимука могло означать «милое страдание» или «тот, кто любит мучиться» — ироничное прозвище для человека, который постоянно жалуется на тяжкую долю, или, наоборот, для того, кто терпеливо сносит невзгоды.

Вторая, более прозаичная версия, — прозвище могло быть связано с профессией или бытовой деталью. «Милимука» могло быть переосмыслением словосочетания «мельник муки» или просто указанием на человека, который занимался помолом и продажей муки, но с ласкательным оттенком («милый мельник»). Однако первая версия — с прозвищным характером — выглядит более убедительной, так как составные прозвища с ироничным значением были типичны для украинской антропонимии.

Географически фамилия Милимука почти наверняка имеет корни в западных регионах Украины или в юго-западной Беларуси. Встречается она крайне редко, что делает её уникальной и легко идентифицируемой. Носители этой фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды, где прозвища приживались особенно прочно. Социальный статус — незнатный, без привязки к дворянским родам. В современной России фамилия практически не встречается, что подтверждает её узкорегиональное происхождение.