Фамилия Милкинтас берет начало от древнего литовского имени Милкинт, состоящего из двух компонентов: «мил» и «кинт». Первая часть именования Милкинт берет начало от литовского прилагательного mylas со значением «милый». Вторая часть имени Милкинт образована от древнего литовского глагола kinta, то есть «преображаться, меняться». Таким образом, именование Милкинт можно трактовать как «тот, кто преображает в милое» или «творящий доброе». Вероятно, родители назвали сына именем Милкинтас, желая, чтобы он вырос добросердечным, благодушным и отзывчивым человеком. Однако система литовско-латышских фамилий сформировалась только к концу XVIII столетия.