Основой фамилии Милкин послужило мирское имя Милка. Мирское имя Милка восходит к корню «мил-» со значением «милый», «любимый, дорогой, желанный», «привлекательный, хорошенький», «нежный, кроткий». Таким образом, Милкой могли назвать горячо любимого ребёнка. Однако не исключено, что в основе фамилии лежит не имя, а прозвище Милка. Так могли называть человека приятной внешности, с кротким нравом, добродушного и незлобивого. Таким образом, фамилия Милкин может указывать и на характер, и на внешность человека, ее получившего. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Милка, со временем получил фамилию Милкин.