Фамилия Мылкин образована от прозвища Мылка, которое берет начало от глагола «мылить» в переносном значении «журить, бранить». Вероятно, именование Мылка отражало особенности характера его обладателя: так могли назвать человека строгого нрава, который часто поучал окружающих и давал им советы, порой излишне навязчиво. За таким человеком прозвище закреплялось как наиболее употребительное именование, а со временем легло в основу фамилии Мылкин — то есть потомок человека с прозвищем Мылка получал фамилию Мылкин.

Интересно, что в данном случае мы имеем дело не с типичной моделью отчества от крестильного имени, а с прозвищной основой, что встречается реже. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Мылкин, то есть сын, внук или потомок Мылки. Сама форма Мылка — это ласкательно-уничижительное окончание, характерное для разговорной речи, что подчеркивает бытовое, неофициальное происхождение прозвища.

В документах фамилия встречается, например, в Книге памяти Свердловской области, где упоминается Андрей Владимирович Мылкин, родившийся в 1904 году в деревне Покровка Называевского района Омской области. Это косвенно указывает на распространение фамилии в сибирском регионе, куда она могла попасть вместе с переселенцами из центральной России. Впрочем, точных данных о географическом ареале фамилии в целом нет — она остается довольно редкой.

Стоит добавить, что однокоренные фамилии Мыльников, Мыльцев, Мыльцевых связаны уже с ремеслом мыловара, тогда как Мылкин стоит особняком: его основа не профессиональная, а поведенческая. Это важное различие — оно позволяет не путать носителей фамилии с потомками мыловаров и точнее понять, что предок Мылкиных был, скорее всего, человеком с характером, а не с особым ремеслом.