Фамилия Мильшина образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Мильшин послужило имя Мильша. Фамилия Мильшин образована от имени Мильша – варианта славянского имени Милош (Милоша). Это имя восходит в общеславянскому корню «мил-» со значением «милый, любимый». Собственно, происхождение этого имени полностью неясно: исторически оно могло быть образовано как непосредственно от общеславянского корня «мил-», так и быть краткой формой более сложных имен, таких как Милослав, Милодраг, Миладин, Милован. В настоящее время это имя популярно у болгар, поляков, сербов. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Мильша, со временем получил фамилию Мильшин. О точном месте и времени возникновения фамилии Мильшин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мильшин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.