Фамилия Минхузин — редкий случай, когда тюркское имя-основа сохранилось почти без изменений, а русский суффикс лишь оформил её как фамилию. В основе лежит мужское имя Минхузя, которое распространено у татар и башкир. Оно состоит из двух частей: «Мин» (в переводе с тюркского — «родинка», «знак», а в переносном смысле — «отмеченный», «счастливый») и «Хузя» (искажённое арабское «Ходжа» — «господин», «хозяин», «наставник»). Таким образом, Минхузя — «господин, отмеченный счастьем» или «счастливый хозяин». Фамилия образована по русской модели притяжательных прилагательных: к основе добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Минхузи). Поэтому Минхузин — это буквально «потомок Минхузи».

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются у русских, модель на -ин типична для фамилий, образованных от имён с конечным гласным или мягким согласным. В татарской и башкирской среде такие фамилии не редкость, но Минхузин выделяется тем, что первая часть имени («Мин») — не арабская и не персидская, а исконно тюркская. Это указывает на то, что фамилия могла сложиться в среде, где сохранялись доисламские элементы именования.

Географически фамилия привязана к Волго-Уральскому региону, преимущественно к Татарстану, Башкортостану и соседним областям. Встречается она нечасто, и это говорит о том, что родоначальник был, скорее всего, крестьянином или ремесленником, а не представителем знати — в дворянских и купеческих родах такие «простые» имена обычно заменяли более престижными арабскими.

Интересная деталь: написание фамилии через «и» (Минхузин), а не через «ы» (Мынхузин) — верное. В тюркских языках звук «и» в первом слоге устойчив, и попытки русифицировать фамилию через «ы» — ошибка переписчиков, которая иногда встречается в старых метрических книгах.