Фамилия Миншакиров образована от имени Миншакир — так в татарской среде называли мальчиков, соединяя тюркское и арабское начала. Первая часть имени восходит к татарскому слову «минле», то есть «тот, у кого есть родинка». Вторая часть — к арабскому имени Шакир, которое переводят как «прославляющий, благодарящий» или «тот, кто ценит то, что имеет». Полное именование Минлешакир, от которого Миншакир является сокращённой формой, можно трактовать как «Шакир с родинкой».

Скорее всего, так называли ребёнка, у которого на видном месте была крупная родинка — в традиционной культуре такая отметина считалась особым знаком, и её старались отразить в имени. Но возможен и второй смысл: нарекая сына Миншакиром, родители вкладывали в имя пожелание, чтобы он вырос благодарным и отзывчивым человеком, умеющим ценить то, что имеет.

Модель образования фамилии проста и типична для тюркских народов: к имени отца Миншакир добавили русский патронимический суффикс -ов. Так потомки человека по имени Миншакир со временем стали Миншакировыми. Фамилия сохранила в себе редкую для русского уха сочетаемость звуков, и по ней до сих пор легко угадывается татарское происхождение рода.