Фамилия Минугалимов — один из тех случаев, когда русская фамилия по форме, но тюркская по происхождению. Её основа — арабское по корню, но давно укоренившееся в татарской и башкирской среде имя Минугалим (варианты: Миннегалим, Минигалим). В переводе с арабского это сложное имя означает «мой (верный) слуга Всевышнего» или «раб Всевышнего» (от «мин» — «я, мой» и «галим» — «всеведущий», один из эпитетов Аллаха). Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Минугалим добавили патронимический суффикс -ов, который в Поволжье и Приуралье стал обычным оформлением для фамилий тюркского происхождения.

Интересна география фамилии. Она практически не встречается за пределами России, и её ядро — Оренбургская область, Башкортостан и Татарстан. Это указывает на то, что предки современных Минугалимовых — скорее всего, тептяри или башкиры, принявшие фамилию в XVIII–XIX веках при переписях и паспортизации. В отличие от дворянских фамилий, которые часто образовывали от полных имён отца, здесь мы видим народную форму: имя Минугалим — это не официальное арабское, а бытовой, «облегчённый» вариант, характерный для устной речи.

Словообразовательная модель проста, но показательна. Суффикс -ов присоединили напрямую к основе, без промежуточных формантов вроде -ин. Это типично для фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. Если бы исходное имя звучало как Минугаля (с окончанием на -я), мы бы получили Минугалин. Но здесь — Минугалим, то есть имя мужского рода на согласный, отсюда и -ов. Такая же модель работает у соседних фамилий: Миннебаев, Минниханов, Минуллин (там другой суффикс, потому что основа на -улла).

Стоит упомянуть и возможность иной, менее вероятной версии. Иногда в тюркских языках «мину» или «мин» может быть частью географического названия или этнонима (например, «мин» — одно из башкирских племён). Но в данном случае имяобразующая модель «слуга + эпитет Бога» настолько распространена в мусульманском именослове (ср. Габдулгалим, Галимулла), что сомнений почти не остаётся: Минугалимов — это «сын Минугалима», а сам Минугалим — человек, чьё имя выражало религиозное смирение.

Фамилия недворянская, нестарая — в документах ранее XVIII века её не найти, как и большинства крестьянских фамилий Поволжья. Носители её — потомки служилых татар, ясачных крестьян или башкир-вотчинников, которые к началу XX века прочно осели на землях Южного Урала.