Фамилия Минжинский — редкий случай в русском ономастиконе, где польская или белорусская модель образования накладывается на неочевидную основу. Суффикс -ский характерен для шляхетских фамилий Речи Посполитой, но в России он встречается и у духовенства, и у мещан, и у крестьян, переселившихся из западных губерний. Если бы фамилия была образована от географического названия (а это самый частый путь для -ский), то исходный топоним должен звучать как Минжин, Минжино или Миньжин. Такие названия есть, но они редки: например, деревня Минжино в бывшей Витебской губернии или урочище Минжин в современной Беларуси. Вполне вероятно, что предок носителя фамилии был выходцем из такого места.

Однако есть и другая версия, более глубокая. Основа «минж» может восходить к литовскому или балтскому корню. В литовском языке есть слово «minžti» — «мочиться», а также «minžis» — прозвище для человека с недержанием или просто грубое, бранное имя. Такие прозвища в XIV–XVI веках, когда шла активная литовско-русская колонизация, не были редкостью: их давали по физической особенности или поведению. Позже прозвище Минжа или Минжий превратилось в фамилию Минжинский через притяжательный суффикс -ин- (чей? — Минжин сын) и типичный дворянский формант -ский. Эта версия объясняет, почему фамилия почти не встречается в центральной России, но локально бытует на западе — в Смоленской, Брянской областях и в Беларуси.

Фамилия не попала в массовые списки дворянства, что говорит о её происхождении скорее из мелкой шляхты или из свободных крестьян, получивших фамилию при переходе на «польский лад» в XVII–XVIII веках. Носители фамилии Минжинский — это, скорее всего, потомки людей, чьё прозвище или место жительства было настолько узко местным, что фамилия не разошлась широко. В современной России она остаётся очень редкой, и её обладатели, скорее всего, имеют корни в западных регионах страны.