Фамилия Миронкина образована от мужского крестильного имени Мирон, которое в переводе с древнегреческого означает «благоухающий» или «источающий благовоние». В основу фамилии легла не сама церковная форма, а её обиходный, уменьшительный вариант — Миронка. Такая модель типична для русских фамилий: суффикс -ин присоединялся к основе, оканчивающейся на -а или -я, и указывал на принадлежность конкретному человеку. Поэтому Миронкина буквально значит «дочь или жена Миронки», а для мужского варианта — «сын Миронки».

Скорее всего, основатель рода Миронкиных был выходцем из простого сословия. В среде крестьян и посадских людей полное имя Мирон использовали реже, чем его домашние формы, которые затем закреплялись в документах и передавались детям как фамилия. Подобные фамилии на -ин часто возникали в северных и центральных русских землях, где была распространена традиция называть человека по отцу в уменьшительной форме. Интересно, что имя Мирон в народной среде иногда сближали со словом «мир», хотя этимологически оно восходит к греческому «мирон» — ароматическое масло, мирра.

Встречаются и другие варианты написания — Миронкин, но форма Миронкина сохраняет исконную основу. Родственные фамилии — Миронов, Миронович, Миронцев — образованы от тех же корней, но с разными суффиксами, что отражает разнообразие местных традиций имянаречения. Таким образом, потомок человека по имени Миронка со временем получил фамилию Миронкина, и сегодня она хранит память о прозвище или домашнем имени далёкого предка.