Фамилия Мирзойев — яркий пример того, как русская фамильная модель «наложилась» на восточное личное имя. В её основе лежит мужское имя Мирзой (встречается также в формах Мирза, Мирзей), которое восходит к персидскому «мирза» — сокращению от «амирзаде», что буквально означает «рождённый эмиром» или «княжич». В тюркских языках слово «мирза» закрепилось как титул для членов правящих династий, а также как почтительное обращение к грамотному, уважаемому человеку — писарю, чиновнику или учёному.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к основе «Мирзой» добавлен типичный русский патронимический суффикс «-ев», указывающий на принадлежность («чей?» — Мирзойев). По тому же принципу образованы фамилии Хамзойев, Ахмедойев, Хасойев — все они фиксируют отчество от восточного имени на согласный. Интересно, что в русской передаче конечный «й» основы (Мирзой) перешёл в суффикс, что создаёт характерное окончание «-ойев», не путать с более частым «-аев» или «-иев».

Географически фамилия Мирзойев наиболее распространена среди народов Северного Кавказа, особенно у ингушей и чеченцев, а также встречается у таджиков и народов Закавказья. В славянской среде она редка и обычно указывает на недавние (в пределах нескольких поколений) миграции с Кавказа или из Средней Азии.

По социальному происхождению предки носителя этой фамилии могли быть как из знатных родов (если титул «мирза» передавался по наследству), так и из служилого сословия — писцов, дипломатов, сборщиков налогов. В любом случае, имя Мирза изначально несло оттенок уважения и образованности, что отличает эту фамилию от фамилий, образованных от простых ремёсел или прозвищ.