Фамилия Мисаковский звучит как типичная фамилия польского или западнорусского дворянства, и это первое, что бросается в глаза. Суффикс -ский указывает на происхождение от географического названия — скорее всего, от имени населённого пункта Мисаково или Мисаки. Такая модель образования характерна для шляхты Речи Посполитой: владелец поместья или выходец из села получал фамилию по его названию. В русской традиции фамилии на -ский тоже встречались, но чаще у духовенства или дворян, переселившихся с западных земель.

Основа Мисак- неочевидна. Проще всего предположить, что это вариант имени Мисаил (древнееврейское «испрошенный у Бога»), которое в просторечии могли сокращать до Мисак. В таком случае фамилия образована от крестильного имени, что для носителей -ский нетипично, но возможно: иногда так закреплялось прозвище целого рода. Другая версия — польское или белорусское прозвище от слова misak, означающего человека, который любит миски, то есть еду, или же того, кто их делает. Это менее вероятно, но не исключено, если фамилия не дворянская, а крестьянская, возникшая позже.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи: современная Беларусь, Польша, Украина. Встречается и у еврейских носителей, что объяснимо: в XIX веке евреям, получавшим фамилии в черте оседлости, часто давали окончание -ский по названию местечка. Если ваш предок носил фамилию Мисаковский, он мог быть либо мелкопоместным шляхтичем из-под Минска или Гродно, либо жителем местечка Мисаки, либо потомком человека по имени Мисаил, чей род записали по-польски.

В написании фамилии возможны варианты: Мисаковский и Мисаковски (в польской передаче). Спор о корне — имя или топоним — решается архивными данными: если в метриках указано «из села Мисаково», версия с географией сильнее. Но без конкретного документа обе гипотезы равноценны.