Фамилия Мисежникова — редкая и сложная для однозначного толкования. Её основа, скорее всего, восходит к профессиональному прозвищу или названию ремесла, связанного с обработкой металла. Разберём словообразовательную цепочку.

В центре фамилии — корень «-мисеж-». Он явно образован от диалектного или устаревшего слова. Наиболее вероятная версия: основа «мисеж» — это искажённое «мизгирь» (паук) или производное от глагола «мизгать» (плести, сучить нить, а в переносном смысле — делать мелкую, кропотливую работу). Однако в контексте фамилии более правдоподобна связь с термином «мисюрка» — старинный русский шлем с кольчужной сеткой. Мисюрники — мастера, изготавливавшие такие шлемы и кольчуги. В говорах слово могло редуцироваться до «мисеж» или «мисежник» — кузнец, занимающийся плетением кольчужной брони. Суффикс «-ник» в основе «Мисежник» прямо указывает на род занятий: так называли человека по его делу.

Суффикс «-ов-» в окончании фамилии (Мисежников) — стандартный русский патронимический формант, означающий «сын» или «принадлежащий». Полная форма «Мисежникова» — женский вариант фамилии, но исторически она образована от мужского прозвища: «Чей сын? — Мисежников». То есть предок носительницы фамилии был либо самим мисежником (кузнецом-кольчужником), либо его потомком.

Географически фамилия крайне редка. Встречается преимущественно в центральных и южных областях России, где исторически было развито кузнечное и оружейное дело (Тульская, Рязанская, Калужская губернии). Второй, менее вероятный вариант происхождения — от личного имени или прозвища Мисеж, которое могло быть образовано от уменьшительной формы канонического имени Михаил (через формы Михей, Миша, Мисега). Но профессиональная версия выглядит убедительнее, так как суффикс «-ник» в русских фамилиях редко присоединялся к личным именам, почти всегда — к названиям занятий.

Таким образом, Мисежникова — фамилия, указывающая на предка-ремесленника, мастера по изготовлению защитных доспехов, вероятно, кольчужника или кузнеца-оружейника. Это не дворянская, а крестьянская или посадская фамилия, возникшая в среде профессиональных мастеровых людей.