Фамилия Мищеряченко — яркий пример того, как украинская словообразовательная модель «накладывается» на русское или тюркское по происхождению прозвище. Её основа — «Мищеряк» или «Мищеряка», а суффикс -енко однозначно указывает на украинское происхождение: в Украине и на юге России так образовывали фамилии, означавшие «сын» или «потомок» (ср. Шевченко — сын Шевца, Коваленко — сын Коваля). В данном случае Мищеряченко — это «сын Мищеряка».

Ключ к пониманию фамилии — в корне «мищер-». Скорее всего, он связан с этнонимом «мещера» (или «мищера»). Мещера — это древнее финно-угорское племя, жившее по среднему течению Оки, которое со временем растворилось среди славян. В русских говорах «мищеряк» или «мещеряк» — прозвище человека, происходящего из Мещеры (исторической области в Рязанской и Владимирской губерниях) либо внешне или по говору напоминающего местных жителей. Встречается и другая версия: в некоторых диалектах «мищеряк» — это человек маленького роста или щуплого телосложения, но она менее убедительна, так как первичным всегда остаётся географическое указание.

Стоит обратить внимание на написание: фамилия пишется через «и» — Мищеряченко, а не Мещеряченко. Это может указывать на акающее произношение, закреплённое в документах (в южнорусских и украинских говорах «е» в безударной позиции переходило в «и»). Встречаются однокоренные фамилии — Мищеряков, Мищерский, а также более распространённая Мещеряков. Мищеряченко — вариант, который чётко локализует носителей: это выходцы с Левобережной Украины или Слобожанщины (современные Харьковская, Сумская области), где фамилии на -енко особенно типичны.

География фамилии узкая: по данным открытых источников, основные очаги — Украина (особенно Полтавская и Черниговская области) и приграничные районы России (Белгородская, Курская области). Встречаемость невысокая, что говорит о том, что фамилия не разошлась широко за пределы региона, где её дали. Сословно предки Мищеряченко, скорее всего, были казаками или крестьянами (государственными, не крепостными), так как на Украине фамилии на -енко в XVII–XVIII веках массово закреплялись именно за казацкими родами.

Таким образом, Мищеряченко — это «сын человека из Мещеры» или «потомок того, кого прозвали Мищеряком». Фамилия несёт в себе следы древнего финно-угорского племени, украинской модели наследования и региональной диалектной особенности произношения.