Фамилия Мишейкина образована от имени Мишейка, которое является производной формой мужского крестильного имени Михаил. Это имя в переводе с древнееврейского языка означает «подобный Богу». Скорее всего, основатель рода Мишейкиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, которого звали Мишейка, со временем получил фамилию Мишейкина.