Фамилия Мышейкин — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, не связано с животным напрямую, а образовано от дохристианского личного имени. В старину на Руси существовали охранительные имена-обереги: чтобы злые силы не позарились на ребёнка, его нарекали Мышью, Волком, Козлом. Считалось, что с таким именем нечисть пройдёт мимо — ну что взять с Мыши? От имени Мышь и пошла фамилия Мышейкин через цепочку: Мышь → Мышейка (уменьшительно-ласкательная форма) + суффикс -ин, который указывает на принадлежность («чей?» — Мышейкин, то есть сын Мышейки).

Суффикс -ин в русских фамилиях типичен для основ, оканчивающихся на -а/-я: Мышейка — Мышейкин, как Кузьма — Кузьмин, Илья — Ильин. Встречается и параллельная форма Мышкин, но Мышейкин образована от более архаичного варианта прозвища. Географически фамилия привязана к северным и центральным областям России — в переписях XVII–XVIII веков крестьяне с таким прозвищем фиксировались в Вологодской и Костромской губерниях.

Есть и вторая, менее вероятная версия: в некоторых говорах «мышей» называли человека маленького роста, юркого или суетливого. Однако прозвища по внешним чертам обычно образовывали фамилии с суффиксом -ов (Мышев), а не -ин. Поэтому версия с охранительным именем выглядит убедительнее.

Сейчас фамилия Мышейкин встречается редко, в основном в Поволжье и на Урале — в местах, куда переселялись крестьяне из центральных губерний в XIX веке. Если вы носите эту фамилию, ваш предок с большой вероятностью жил в северной деревне и носил имя-оберег Мышейка, чтобы отпугнуть от себя беду.