Фамилия Миускин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить случайные или искажённые варианты, наиболее вероятная основа — топоним или прозвище, связанное с рекой Миус. Эта река протекает по территории современной Украины и России (Ростовская область, Донбасс) и дала название нескольким населённым пунктам, например посёлку Миус. Жителей по берегам Миуса в просторечии могли называть миусами или миускими, а их потомков — Миускиными. Формант -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Миускин, то есть сын или потомок человека, связанного с Миусом.

Вторая версия, менее распространённая, но возможная в диалектной среде, — от прозвища Миуска. В некоторых южнорусских говорах «миускать» означало мяукать, и Миуской могли дразнить человека с тонким, «кошачьим» голосом или привычкой мяукать в шутку. Суффикс -ск- в прозвище Миуской (а затем -ин в фамилии) нестандартен для чисто прозвищной модели, но встречается в фамилиях, образованных от уличных кличек на -ской.

Географически фамилия Миускин тяготеет к югу России и востоку Украины — именно там, в бассейне Миуса, она могла возникнуть и закрепиться. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она почти не фиксируется; это говорит о том, что фамилия либо редкая, либо поздняя (сформировалась уже после отмены крепостного права, когда крестьянам массово давали фамилии по месту жительства). Среди известных носителей нет публичных фигур, поэтому судить о дворянском или купеческом происхождении не приходится: скорее всего, Миускины — потомки крестьян или казаков Приазовья.

Интересная деталь: фамилия Миускин могла возникнуть независимо в разных семьях, но по одному принципу — от реки Миус. Это ставит её в один ряд с фамилиями вроде Волгин, Донской, Уральцев, но с той разницей, что Миус — река региональная, а не общерусская, и потому фамилия осталась локальной.