Фамилия Мизандронцев — один из тех редких случаев, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а книжное, почти античное слово. Корень здесь — «мизандр» (от греческого misandria — ненависть к мужчинам). Казалось бы, прозвище Мизандр или Мизандрон мог получить человек с нелюдимым, женоненавистническим характером. Но в русской провинции XIX века такие прозвища часто давали не за реальное поведение, а по насмешке или наоборот — как «защитное» имя, которое должно было отпугнуть злые силы. Вряд ли крестьянина или мещанина в самом деле называли так за мизантропию: скорее, это была деревенская ирония или прозвище, прицепившееся к человеку, который вёл замкнутый образ жизни.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: прозвище Мизандрон (с греческим окончанием, характерным для заимствованных имён в семинарской среде) обрастает суффиксом -цев. Суффикс -цев (-цов) указывает на принадлежность: «сын Мизандрона» или «из рода Мизандроновых». Встречается он в центральных и южнорусских областях, но фамилия Мизандронцев географически привязана к Поволжью и отчасти к Уралу — там, где в XVIII–XIX веках были сильны старообрядческие общины и где книжные, церковнославянские имена давали детям в память о святых или по монашеским образцам. Однако «Мизандр» в святцах не значится, так что прозвище явно светское, возможно, из семинарского или училищного обихода.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: что основа — диалектное слово «мизандра» (нечто мелкое, негодное) или искажённое «мизгирь» (паук). Но для неё нет надёжных словарных подтверждений. Гораздо правдоподобнее, что перед нами редкий случай фамилии, образованной от греческого корня, который попал в русскую среду не через академическую филологию, а через устное прозвище, возможно, данное человеку с трудным, «женоненавистническим» нравом. Носителей фамилии немного, и в дореволюционных переписях она почти не встречается — это говорит о позднем закреплении (не раньше середины XIX века) и о том, что род, скорее всего, был немногочисленным и оседлым.