Фамилия Мизгеров — пример того, как редкое или устаревшее слово ложится в основу фамилии, а суффикс -ов указывает на «сына» или «потомка» человека с таким прозвищем. Корень здесь — «мизгирь». В старых говорах (особенно южнорусских и поволжских) «мизгирь» — это паук, тарантул. В словаре Даля это слово зафиксировано именно в таком значении: «мизгирь — паук, мизгирёк — паучок». Прозвище Мизгирь могли дать человеку за сходство с пауком: либо за цепкость, хозяйственность, способность «плести сети» (то есть ловко вести дела), либо за внешность — сутулость, длинные конечности.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с гидронимом: в бассейне Оки есть речка Мизгерка, и житель её берегов мог получить прозвище Мизгер. Однако отсутствие массовой топонимической основы (озёр, сёл с таким названием) делает эту гипотезу слабой. Основной версией остаётся прозвище от насекомого.

Морфологически фамилия прозрачна: основа Мизгер (чередование г/ж в корне мизгирь/мизгер — диалектное явление) плюс типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность. Мизгеров — буквально «сын Мизгера». Фамилия встречается редко, преимущественно в Нижегородской области и в Поволжье, что косвенно подтверждает её южнорусско-поволжскую диалектную основу. Фамилий с таким корнем немного, и они не смешиваются с другими: в отличие от, скажем, Пауковых, Мизгеровы — носители более архаичного локального слова, почти исчезнувшего из живого языка.