Фамилия Моголянов — редкая и неочевидная с точки зрения корня. Если отбросить типичное окончание -ов, указывающее на принадлежность («чей?» — сын Моголяна), остаётся основа «Моголян». Именно в ней и кроется загадка. Сразу заметим: версия о связи с монголами или Монголией, хоть и напрашивается, скорее всего ложная. Фонетически «Моголян» не выводится напрямую из этнонима «монгол» через русское посредство — для этого потребовались бы сложные и маловероятные искажения.

Надёжнее искать корень в диалектной или профессиональной лексике. В южнорусских и украинских говорах известно слово «моголь» — так называли сильного, крупного человека, здоровяка. В некоторых областях «моголем» могли прозвать и зажиточного крестьянина, «могущего» хозяина. Тогда Моголян — это сын или потомок Моголя, то есть человека с таким прозвищем. Суффикс -ян в основе — не русский, а скорее тюркский или армянский (сравните: Оганян, Акопян), что может указывать на регион бытования фамилии. Возможно, Моголяновы — это обрусевшая ветвь, где к исходной фамилии на -ян добавили русский суффикс -ов для согласования с падежной системой. Такое встречается в Поволжье и на Северном Кавказе, где смешивались русские, татарские и армянские фамильные модели.

Ещё одна версия, менее вероятная, но имеющая право на существование: прозвище Моголь могло возникнуть от названия ремесла. В некоторых говорах «моголить» означало «мять, месить, работать с глиной» — отсюда моголь, гончар. Однако эта гипотеза слабо подтверждена лексикографически.

Фамилия Моголянов не входит в списки распространённых дворянских родов и не фиксируется в дореволюционных адрес-календарях. Скорее всего, она крестьянского или мещанского происхождения, и её носители жили в южных губерниях России или в областях с тюркским субстратом. Сегодня она встречается единично, что делает её ценной для семейной истории: каждый Моголянов — носитель редкого прозвищного имени, которое почти не сохранилось в других формах.