Фамилия Могом — редкий случай, когда основа не поддаётся однозначной славянской этимологии. В ней нет привычного суффикса принадлежности (-ов, -ин), что сразу указывает: перед нами не типичная русская фамилия, образованная от имени или прозвища отца. Скорее всего, это фамилия, возникшая из прозвища или адаптированного иноязычного имени.

Самый вероятный источник — тюркское или кавказское имя Могом. Это сокращённая форма от имени Магомед (араб. Мухаммад), распространённая у народов Северного Кавказа, особенно у чеченцев, ингушей и дагестанцев. В русской среде такие имена нередко усекались до одного-двух слогов: Магом → Могом. В таком случае фамилия буквально означает «сын Могома» или просто «Могом», закрепившись в документах при переписи населения. География фамилии это подтверждает: большинство носителей Могом живут на Северном Кавказе, в первую очередь в Чечне и Ингушетии.

Есть и менее распространённая версия, связывающая фамилию с осетинским словом «могом» — «сильный», «могучий». Но она слабее: в осетинской ономастике подобные прозвища обычно оформляются суффиксами, а не в чистом виде. К тому же фонетически «могом» ближе к тюркскому «магъум» (печальный, скрытный), но и эта гипотеза не находит серьёзной опоры в фамильных списках.

Фамилия Могом не попала в дворянские родословные книги Российской империи — её носители были в основном крестьянами и горцами, получившими фамилии при массовом учёте в XIX — начале XX века. Записывали её на слух, поэтому возможны варианты: Могам, Магом, Могомов. Последний вариант встречается реже, но он как раз «русифицирует» фамилию, добавляя суффикс -ов. Однако в исходном виде Могом — это пример фамилии, которая сохранила свою первоначальную, «голую» форму, не обросшую типичными русскими окончаниями.