Фамилия Моисеенков отвечает на вопрос «чей?» и образована от имени Моисей через цепочку поколений. В основе лежит крестильное мужское имя Моисей, которое пришло на Русь вместе с православием. С древнееврейского его обычно переводят как «спасенный из воды» или «вынутый из воды» — это прямой отсыл к библейскому сюжету, когда младенца Моисея нашли в корзине на берегу Нила.

Словообразовательная модель здесь двойная. Сначала от имени Моисей возникла краткая или обиходная форма Моисеенко — так в украинской и белорусской традиции называли сына, внука или потомка Моисея. Суффикс -енко в этих землях указывал на родство по мужской линии. Затем, когда носитель фамилии Моисеенко оказался в великорусских губерниях, фамилию русифицировали: к ней добавили типичный русский суффикс -ов, получив Моисеенков. Такой переход — частое явление в XVIII–XIX веках, когда украинские и белорусские фамилии адаптировали под местные нормы, чтобы они звучали привычно для русского уха.

Сам суффикс -ов в финале указывает на притяжательность: буквально Моисеенков значит «из рода Моисеенко». Подобные перестройки встречаются у многих фамилий: например, Иващенко превращалось в Иващенков, а Гончаренко — в Гончаренков. Поэтому Моисеенков — это не самостоятельное имя, а поздняя форма, которая сохранила память о более древней южнорусской основе.

Имя Моисей было распространено в крестьянской и мещанской среде, особенно в южных и западных регионах Российской империи. Оно не принадлежало только знати или духовенству, так что предки Моисеенковых могли быть кем угодно: земледельцами, ремесленниками или казаками. Точных документальных свидетельств о конкретном родоначальнике нет, но сам тип фамилии говорит о том, что её носитель жил не раньше XVII века, когда фамилии начали закрепляться у непривилегированных сословий.

Стоит отметить, что параллельно существовали и другие формы от того же имени: Моисеев, Моисеевич, Моисейкин, Моисеенко. Фамилия Моисеенков выделяется тем, что в ней скрестились две традиции — украинская модель с -енко и русская с -ов. Такое сочетание делает её своеобразным маркером миграции: предки, вероятно, перебрались с Украины или Беларуси в центральную Россию, где фамилия обрела современное звучание.