Фамилия Мохунов — редкий случай, когда исходное слово почти исчезло из живого языка, а фамилия его законсервировала. В основе лежит прозвище Мохун. Что оно означало — вопрос, на который нет однозначного ответа, но есть две основные версии.

Первая и самая прямая: Мохун — производное от слова мох. В русских говорах мохом могли называть не только растение, но и человека с пышными, торчащими волосами, бородой или даже неухоженного, заросшего. Прозвище Мохун в этом ряду — уменьшительно-уничижительная форма, как лисун, горбун. Такая модель типична для XV–XVII веков, когда прозвища на -ун (хохотун, ворчун) были распространены и легко переходили в фамилии. Суффикс -ов в конце — стандартный патронимический: Мохунов — сын Мохуна.

Вторая версия — диалектная. В некоторых областях «мохун» или «махаун» означало неуклюжего, медлительного человека, увальня. Слово могло быть связано с глаголом «мохнуть» (вянуть, сохнуть) или с «мохнатый» в переносном смысле (неряха). Если принять эту версию, фамилия указывала на характер или внешность первого носителя.

Географически фамилия Мохунов встречается крайне редко. Основные очаги — Урал и Зауралье (Пермский край, Свердловская область, Курганская область), а также единичные записи в центральной России. Такая локализация подсказывает, что фамилия могла сложиться в среде черносошных крестьян или горнозаводского населения, где прозвища давали метко и без затей. Дворянских родов с такой фамилией нет — это стопроцентный вариант крестьянской или мещанской среды.

Сравните с однокоренными: Мохов (от «мох» — более прозрачно), Мохнаткин, Мохначев. Мохунов стоит особняком: суффикс -ун делает его «характерологическим» — такой тип фамилий обычно возникал из прозвищ, а не из названий профессий или местности. Если ваш предок Мохунов, он, скорее всего, получил прозвище за внешность или манеру поведения, и это прозвище закрепилось в документах именно в такой форме.