Фамилия Мокотрова — женская форма, мужской вариант — Мокотров. Она звучит нехарактерно для русского уха, и это подсказка: её корни, скорее всего, не в славянских прозвищах, а в географических названиях народов Поволжья или Приуралья. В русской ономастике фамилии на -ов/-ев типичны, но основа «Мокотр» почти не встречается в старорусских документах, что указывает на её заимствованный характер.

Самый вероятный источник — мордовское (эрзянское или мокшанское) слово «мокот» или «мокотра», которое могло означать «круг», «обруч», «кольцо» или, в переносном смысле, «замкнутое пространство», «укреплённое место». В некоторых говорах так называли изгиб реки или излучину. Если предок носителя фамилии жил у такой излучины или владел участком, ограниченным рекой, его могли прозвать «Мокотр», то есть «живущий на мокотре». Со временем прозвище превратилось в фамилию, а суффикс -ов добавил значение принадлежности: «сын Мокотра».

Вторая, менее распространённая гипотеза связывает основу с тюркскими языками. В казахском и татарском есть слово «мок» (или «мокы») — «крепкий», «прочный», а «отра» может быть искажением от «ата» (отец) или «ура» (сын). Тогда «Мокотра» могло означать «крепкий парень» или «сын крепкого». Однако эта версия слабее, потому что в фамилиях народов Поволжья чаще встречается именно мордовский пласт, а тюркские заимствования обычно оформляются иначе (например, с суффиксами -баев, -галиев).

Географически фамилия Мокотрова/Мокотров сегодня встречается в основном в Мордовии, Татарстане, а также в Ульяновской и Нижегородской областях. Это зона расселения мордовских народов, что подтверждает первую версию. Носители фамилии могли быть крестьянами, жившими при реке, или ремесленниками, делавшими обручи для бочек (мокотры). В любом случае, фамилия редкая и не стёртая временем — она сохранила прямую связь с местным ландшафтом или занятием.