Фамилия Молдакимова — женская форма фамилии Молдакимов, и её разбор стоит начать с неочевидного: с суффикса. В русской фамильной модели суффикс -ов (в женском роде -ова) стандартно указывает на принадлежность: «чей?» — Молдакимов, то есть потомок человека по прозвищу или имени Молдаким. Но сама основа фамилии явно не славянская, а тюркская, и здесь кроется главная особенность.

Корень «Молда-» восходит к тюркскому слову «молда» (варианты: молла, мулла) — так называли мусульманского священнослужителя, грамотея или учителя в медресе. В казахском, киргизском, башкирском и татарском языках «молда» — это не просто духовное лицо, а часто уважаемый человек, знающий арабскую письменность и Коран. Вторая часть — «ким» — может быть как личным именем (в тюркских языках Ким, Кем — нередкое имя), так и указательным местоимением «кто». В сочетании «Молдаким» (или «Молдакем») это могло означать «кто такой молда?» — своего рода вопрос-прозвище, данное человеку, который вёл себя как мулла или претендовал на учёность. Но более вероятно, что «Молдаким» — это сложное имя-оберег: «Молда» + «Ким» (имя). В тюркской традиции нередко давали составные имена, где первая часть указывала на религиозный статус или пожелание, а вторая — на конкретного человека.

Географически фамилия Молдакимова чаще всего встречается у казахов (особенно в Южном Казахстане и Кызылординской области), а также у киргизов и татар. Это указывает на то, что предок носителя фамилии, скорее всего, был связан с исламским образованием или духовенством. В Российской империи такие фамилии закреплялись за выходцами из степных регионов при переходе к оседлости и фиксации в метриках — тогда прозвище отца превращалось в наследственную фамилию для всей семьи.

Словообразовательно фамилия редкая: в русском ономастиконе нет десятков однокоренных вариантов. Если сравнить с фамилиями Молдашев, Молдагалиев, Муллакаев, то видно, что основа «молда» продуктивна, но именно форма «Молдаким» встречается нечасто. Это делает фамилию хорошим маркером конкретного рода, а не массового прозвища.

Так что для носительницы фамилии Молдакимова её предок — скорее всего, уважаемый человек в ауле, мулла или учитель, чьё имя или прозвище закрепилось за потомками через стандартный русский патронимический суффикс.