Фамилия Молдакаримова образована от мужского имени Молдакарим по типичной русской модели с суффиксом -ов (-а — женский вариант). Это имя — сложное, восточное, тюркского происхождения. Первая часть, «молда» (вариант «мулла»), восходит к арабскому слову «маула» — господин, владыка, а в тюркских языках закрепилось в значении «священнослужитель», «грамотей», «учитель». Вторая часть, «карим», — арабское имя, означающее «щедрый», «великодушный» (один из эпитетов Аллаха). Таким образом, имя Молдакарим можно перевести как «щедрый мулла» или «почтенный, щедрый человек».

Фамилия относится к числу тех, что фиксируют не столько профессию, сколько социальный статус или личное качество предка. В отличие от фамилий вроде Кузнецов или Попов, где прямо указано занятие, Молдакаримов указывает на человека, которого уважали за ученость и благородство. В среде татар, башкир, казахов и других тюркских народов такие имена давали неслучайно: они служили пожеланием или характеристикой.

Суффикс -ов в этой фамилии не тюркский, а русский. Это значит, что фамилию оформили по русскому образцу, скорее всего, в XIX — начале XX века, когда у оседлых народов Поволжья и Приуралья начали массово записывать фамилии в метрических книгах. В самой тюркской среде фамилия могла бы звучать как Молдакарим улы (сын Молдакарима) или просто Молдакарим.

Географически фамилия Молдакаримова — редкая. Она встречается в основном у татар и башкир, реже — у казахов. Концентрация носителей заметна в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области и некоторых районах Средней Азии. Интересно, что в русских переписях фамилия практически не фиксируется за пределами этих регионов, что подтверждает её локальный характер.

С точки зрения словообразования, это типичная «патронимическая» фамилия: она прямо называет отца. Но в отличие от фамилий на -ич или -оглы, здесь использована модель, характерная для русских фамилий, что делает Молдакаримову любопытным примером культурного и языкового контакта.