Фамилия Молдоходжаев является самобытным памятником восточной культуры. Фамилия Молдоходжаев образована от тюркского мужского имени Молдоходжа. Первая из них восходит к киргизскому «молдо» - «просвещенный, образованный человек». Вторая часть ведет свое начало от имени Ходжа, которое в переводе с персидского означает «хозяин, владелец, господин», «обладающий большими знаниями, наставник, учитель». Таким образом, потомок человека, которого звали Молдоходжа, со временем получил фамилию Молдоходжаев. Безусловно, фамилия Молдоходжаев представляет собой замечательный памятник восточной культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Молдоходжаев можно лишь на основании серьезных генеалогических исследований.