Фамилия Молотилины — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не требует расшифровки. Корень здесь — глагол «молотить», то есть выбивать зерно из колосьев. Казалось бы, всё очевидно: предок был молотильщиком. Но в русских фамилиях на -ин редко встречается столь прямой глагольный след. Обычно основой служит существительное (Молотков, Молотников) или прозвище по внешности. Молотилин же образован напрямую от основы настоящего времени: молоти- + -л- (суффикс действующего лица) + -ин (притяжательный суффикс). Буквально: «чей? — Молотилин», то есть сын или потомок человека по прозвищу Молотила.

Прозвище Молотила на Руси давали не просто работнику с цепом. В крестьянской среде молотьба была сезонной, но тяжёлой работой, и такое прозвище могло закрепиться за человеком, который отличался физической силой, упорством или, наоборот, неловкостью — как ироничное. Однако в ономастике чаще принимают прямое профессиональное значение: предок Молотилиных был наёмным молотильщиком или владельцем молотильни. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна эта модель (глагольная основа + -л-ин) отмечена как редкая, характерная для северных и центральных губерний, где ценили конкретные ремесленные прозвища.

Географически фамилия Молотилины тяготеет к Вологодской и Костромской областям, а также к Вятке. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Молотила, но в фамильной форме она закрепилась позже, уже в XVIII–XIX веках. Сословно это почти всегда крестьяне, реже — мещане. Дворянских родов с такой фамилией нет, что логично: землевладельцы не брали прозвища по ручному труду.

Интересная деталь: ударение в фамилии плавающее. В одних говорах говорят Молоти́лины (от «молоти́ть»), в других — Молоти́лины с ударением на второй слог, что сближает её с формами типа «молоти́ло» (орудие). Второй вариант встречается реже, но фиксируется в местных документах. Если ваши предки из-под Вологды, скорее всего, они произносили фамилию с ударением на третий слог.

Однокоренных фамилий немного: Молотков, Молотников, Молотобоец. Все они образованы от существительных, а Молотилины стоят особняком — это единственная распространённая русская фамилия, прямо указывающая на процесс молотьбы, а не на орудие труда.