Фамилия Мольцан — редкий случай, когда сразу понятно, что перед нами не русская, а немецкая или еврейская фамилия, адаптированная к восточнославянской среде. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, она не заканчивается на -ов, -ин или -ский, а сохраняет иноязычную основу.

Корень фамилии — немецкое слово «Molzahn» или «Moltzahn». В Германии это топонимическая фамилия, образованная от названия населённого пункта Мольцан (Moltzahn) в Мекленбурге — Передней Померании. Первые носители такой фамилии в немецких землях — это выходцы из этого села, которые получали прозвище по месту жительства. В русском языке фамилия утратила немецкое окончание -ahn, которое на слух воспринималось как -ан, и закрепилась в форме Мольцан.

Однако в России и Украине фамилия Мольцан могла появиться и другим путём. В XVIII–XIX веках немецкие колонисты массово переселялись в Поволжье, Причерноморье и на Волынь. Среди них были и носители фамилии Moltzahn. Со временем, при записи в метрические книги и паспорта, фамилию русифицировали, отбросив второй корень или переосмыслив окончание. Кроме того, у евреев-ашкеназов, живших в черте оседлости, встречалась фамилия Мольцан — как вариант топонимической фамилии от того же немецкого топонима (через идиш).

Словообразовательная модель проста: основа «Мольц-» (от Moltz) + суффикс -ан, который в русском языке часто указывает на принадлежность к группе или местности (ср. «поляк» — «поляне», «мещанин»). Но в данном случае -ан — это не русский суффикс, а остаток немецкого окончания, переосмысленный на славянской почве.

Географически фамилия Мольцан в России и Украине встречается крайне редко. По данным переписей, основные очаги — Волынская область Украины и южные регионы России (Краснодарский край, Ростовская область), где исторически селились немецкие колонисты. Также единичные носители фиксируются в Беларуси и Прибалтике.

Таким образом, предки человека с фамилией Мольцан с высокой вероятностью были немецкими колонистами, переехавшими в Российскую империю в XVIII–XIX веках, или евреями, жившими в западных губерниях. Фамилия не имеет отношения к русским словам «молчать» или «молодец» — это чисто топонимическое заимствование.