Фамилия Моркотыло — одна из тех, что сразу обращает на себя внимание необычным звучанием и редким суффиксом. В отличие от массовых фамилий на -ов, -ин или -ский, она образована по украинской или белорусской модели с суффиксом -ыло, который в восточнославянской ономастике указывает на прозвище, полученное по действию или характерному признаку. Такие фамилии (вроде Крутило, Губило, Пузыло) редко встречаются в центральной России и чаще всего ведут родословную из юго-западных земель бывшей Речи Посполитой.

Основа «моркот» — тёмная, и здесь возможны два объяснения. Первое: связь с диалектным глаголом «моркотать» (или «моркотеть»), который в некоторых говорах означал ворчать, бормотать, говорить невнятно. Тогда Моркотыло — это «ворчун», человек, который постоянно что-то бурчит себе под нос. Второе, менее правдоподобное, но встречающееся в любительских этимологиях — от слова «морковь» (распространённая ошибка, когда фамилию «притягивают» к знакомому корню). Однако суффикс -ыло не характерен для названий овощей, а вот для прозвищ по поведению — вполне. К тому же в украинских и белорусских говорах есть слово «моркот» — нечто вроде «воркотни», что подтверждает первую версию.

С географической точки зрения фамилия редкая. Основные очаги — Черниговская и Сумская области Украины, а также юг Беларуси. В России она встречается единично, чаще всего у потомков переселенцев с Украины в XIX — начале XX века. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или казаками: фамилии на -ыло не типичны для дворянства и духовенства.

Особенность написания — конечное -о, а не -а. В украинском языке фамилия могла звучать как Моркотыло или Моркотило (через «і»), а в русской записи закрепилась форма с «ы». Если сравнивать с однокоренными, то в польских и белорусских метриках встречается фамилия Моркот, а в украинских — Моркотун, что тоже образовано от того же глагола со значением «ворчать».

Таким образом, фамилия Моркотыло — редкое прозвищное имя, которое закрепилось за предком с неспокойным или ворчливым нравом. Она не имеет отношения к овощам, а её носители — выходцы из западнорусских земель, где такие прозвища были в ходу.