Фамилия Москонин — одна из тех, где основа спорит с суффиксом. Если смотреть на концовку, то это типичная русская фамилия на -ин. Такая модель обычно означает «чей?» — сын или человек, принадлежащий тому, кто назван в корне. То есть Москонин — «сын Москони». Но корень «Москон-» в русском языке не встречается ни как имя, ни как прозвище в чистом виде. Тут и кроется главная загадка.

Самая вероятная версия — перед нами не прямое прозвище от слова «Москва», а его производное, прошедшее через уменьшительно-ласкательную или уничижительную форму. В русских говорах, особенно северных и сибирских, фамилии вроде Москвин, Москвитинов, Московкин — обычное дело. Москонин могло возникнуть от прозвища Москоня (человек, связанный с Москвой — выходец оттуда, торговец, приказчик). Суффикс -оня даёт оттенок просторечия, почти ласкательности: Москоня — «москвичок», «москвич». От этого прозвища по правилам русского языка и образовалась фамилия: Москоня → Москонин. Подтверждение этой модели — фамилии вроде Сазонин (от Сазоня), Федюнин (от Федюня) и десятки других.

Второй вариант, менее очевидный, — связь с диалектным словом «москонь» или «москота». В некоторых говорах так называли мелочного, суетливого человека, а в рязанских и тульских краях — ещё и скупого. Но это слово крайне редкое, и письменных подтверждений его широкого хождения нет. Если фамилия возникла именно от него, то предок получил прозвище за характер, а не за место жительства.

География фамилии подсказывает, что её носители издавна жили на севере и северо-востоке России. В переписных книгах XVII–XVIII веков Москонины встречаются в Вятской губернии (современная Кировская область), в Пермском крае и в Архангельской губернии. Это регионы, куда шёл активный поток переселенцев из центральной России, и прозвище «Москоня» как раз и могло закрепиться за выходцем из московских земель, чтобы отличить его от местных.

Так что, скорее всего, Москонин — это не «житель Москвы», а «сын того, кого называли Москоней». По сути, фамилия хранит память о предке, который пришёл откуда-то с юга или запада и получил простое деревенское прозвище, а его потомки разнесли эту фамилию по всей северной Руси.