Фамилия Московенкова — женская форма, а её исходный мужской вариант — Московенков. В основе фамилии лежит не столица, как можно было бы подумать, а прозвище или имя, образованное от топонима Москва, но не напрямую. Ключ к пониманию — суффикс «-енков». Эта модель типична для южнорусских и украинских фамилий (сравните: Донченко, Гончаренко), где «-енко» означало «сын» или «потомок». В русском варианте «-енков» — это обрусевшая или адаптированная форма того же патронимического суффикса.

Формант «-енков» указывает на то, что предок носителя фамилии был не просто «москвичом», а «Московенком» — то есть сыном человека по прозвищу Москов. Само прозвище Москов (или Москва) в старину давали выходцам из Московского княжества, переселенцам в другие земли. В XVI–XVII веках, когда шло активное заселение южных окраин (Дикое поле, Слобожанщина), туда уходили люди из центральных областей. Их и прозывали по месту прежнего жительства: Москва, Московец, Московенок. Со временем прозвище закрепилось за детьми и внуками, превратившись в фамилию.

Словообразовательная цепочка выглядит так: топоним Москва → прозвище Москов → патроним Московенок (сын Моськи или Московца) → фамилия Московенков. Суффикс «-енков» в русских фамилиях встречается реже, чем «-ов» или «-ин», и часто указывает на регион происхождения рода — Тамбовская, Воронежская, Курская губернии, а также территории, где смешивались русские и украинские говоры. Таким образом, носители фамилии Московенковы, скорее всего, происходят из крестьян или служилых людей, переселившихся с севера на юг в эпоху Московского царства.

Встречается и более редкая версия: связь с личным именем Москов, которое могло быть нецерковным, мирским именем. В древнерусской традиции детей называли в честь рек или городов, чтобы «привязать» к родной земле или в память о паломничестве. Но для этой фамилии географическая привязка к переселенцам выглядит убедительнее: слишком много однотипных фамилий (Калуженков, Тульченков, Рязанцев) строится по той же модели и указывает на движение населения.