Фамилия Мотошенко — характерный пример украинской модели фамилиеобразования с суффиксом -енко. Этот суффикс, изначально уменьшительный, в XVI–XVII веках закрепился в значении «сын» или «потомок» (буквально «маленький Мотоша») и стал самым массовым способом создания фамилий на Левобережной и Слободской Украине. Мотошенко — значит «чей-то сын или потомок Мотоши».

В основе фамилии лежит прозвище Мотоша. Его происхождение спорно, но наиболее правдоподобных версий две. Первая связывает прозвище с диалектным глаголом «мотать» в значении «тратить, расточать». Мотошей на Украине могли назвать человека нерасчетливого, склонного к пустым тратам, кутилу — то есть «мотыгу» в переносном смысле. Вторая версия отталкивается от «мотать» как «наматывать, сматывать»: прозвище мог получить ткач, прядильщик или тот, кто занимался намоткой ниток. В пользу этой гипотезы говорит распространенность ремесленных прозвищ у украинских крестьян и казаков.

Менее вероятна, но встречается в любительских толкованиях связь с тюркским словом «мот» (сильный, могучий) или с названием реки Мот (приток Днепра). Никаких надежных лингвистических подтверждений эти гипотезы не имеют: суффикс -енко и характерное украинское чередование о/і (Мотоша — Мотошенко) указывают на славянскую, а не тюркскую основу.

Географически фамилия Мотошенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Черкасской, Полтавской, Киевской, а также к югу России (Кубань, Ростовская область), куда украинские переселенцы массово уходили в XVIII–XIX веках. В дореволюционных ревизских сказках и метрических книгах носители фамилии встречаются преимущественно среди казаков и государственных крестьян, что подтверждает ее демократическое, а не шляхетское происхождение.

Таким образом, Мотошенко — это фамилия-характеристика, которая либо указывала на ремесло предка (мотальщик), либо на его черту характера (расточительный человек), но в любом случае возникла в украинской народной среде по самой типичной для нее словообразовательной модели.